В соответствии с Законом Кыргызской Республики «О музеях и Музейном фонде Кыргызской Республики», государственное управление в сфере музейного дела осуществляется Кабинетом Министров Кыргызской Республики через Министерство культуры, информации, спорта и молодежной политики, а также местными государственными администрациями и органами местного самоуправления. 

В Кыргызской Республике на сегодняшний день функционируют около 118 музеев, из которых 68 - государственные. Оставшиеся 86 музеев  ведомственные и школьные.

Государственные музеи: (68) Из государственных музеев значительная часть (примерно 70-80%) представляют собой исторические, краеведческие и мемориальные музеи.

Ведомственные музеи: (6) существуют музеи, связанные с различными государственными учреждениями, например, Центральный музей МВД КР им. полковника С. Наматбаева, Музей им. Курманбай Талканчиева при ГУВД г.Бишкек, Зоологический музей при Национальной академии наук КР, Музей геологии и музей минералогии, Музей науки и образования, Музей им. М.Мамакеева при Министерстве здравоохранения КР,

Школьные музеи: (33) выполняют важную образовательную функцию, представляют коллекции, связанные с конкретными научными дисциплинами или историей образовательных учреждений.

Частные музеи: Кроме этого в Кыргызстане существуют частные музеи посвящённые определённым аспектам истории, искусства или культуры. Из них наиболее известные и часто посещаемые:

В г.Бишкек, Дом-музей Чынгыза Айтматова, дом-музей Туголбай Сыдыкбекова, музей “Өрнөктүү инсандар”, Этнографический музей «Супара», Музей Великой Пустоты, Галерея М, Детская лаборатория экспериментов (музей ДНК).

Многие музеи имеют историческое значение как сами здания, так и их связь с историческими событиями или личностями.

- 2 музейных комплекса являются объектами ЮНЕСКО;

- 18 музеев являются объектами ИКН республиканского значения (список утв. постановлением ПКР от 20.08.2002 г. № 568);

- 10  музеев ИКН городского значения г.Бишкек (список утв. ПКМ КР от 5.03.2021 г. № 58).

Нормативно-правовая база музеев:

Закон Кыргызской Республики «О музеях и Музейном фонде Кыргызской Республики» (24 июля 2015 года, №193) — регулирует основные принципы и правила функционирования музеев в стране.

Инструкция по учету и хранению музейных предметов и коллекций (Приказ МКИТ №617 от 15.12.2016 г.) — определяет организацию учетной работы, методы хранения, использования и реставрации музейных ценностей.

Порядок включения и исключения музейных предметов в Музейный фонд Кыргызской Республики (Приказ МКИТ №61 от 22.02.2017 г.) — устанавливает правила для включения и исключения предметов из музейного фонда.

Положение о Государственном каталоге Музейного фонда Кыргызской Республики (Приказ МКИТ №61 от 22.02.2017 г.) — регулирует порядок формирования и ведения государственного каталога.

Порядок создания и функционирования музеев в Кыргызской Республике (Приказ МКИТ №460 от 08.11.2017 г.) — описывает правовые основы создания и работы музеев.

Страхование музейных предметов и коллекций:

Страхование музейных предметов и коллекций при их временном вывозе за пределы страны для экспонирования, реставрации или научной экспертизы осуществляется через Кыргызгосстрах. Важно, что при перемещении музейных предметов за пределы музея обязательно их страхование, охватывающее все риски, связанные с упаковкой, транспортировкой, складированием, монтажом, экспонированием и возвратом на место постоянного хранения.

Оценка страховых рисков проводится фондохранилищем музея, осуществляющим выдачу предметов. Стоимость предметов определяется с учетом текущих мировых цен на антиквариат.

Государственный контроль за состоянием Музейного фонда:

Музеи регулярно проводят проверки наличия и сохранности своих фондов. Комиссии, образованные на основании приказа директора музея, проводят эти проверки, чтобы удостовериться в соответствии фактического состояния музейных предметов учетной документации. План-график проверок составляется в зависимости от объема музейного фонда.

Частота проверок:

Для музеев с количеством фондов от 500 до 3000 единиц — 1 раз в 2 года.

От 3000 до 30000 единиц — 1 раз в 3 года.

От 30000 до 300000 единиц — 1 раз в 5 лет.

При утрате или исключении музейных предметов из учета, музеи обязаны направить акты проверки в уполномоченный государственный орган в сфере культуры.